Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdk5rap3Q99LM2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms