Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SardhQ99LB7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms