Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms