Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lims1Q99JW4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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