Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cldn16Q925N4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Cldn16Q925N4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Cldn16Q925N4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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