Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

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Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim7Q923T7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim7Q923T7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim7Q923T7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim7Q923T7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim7Q923T7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim7Q923T7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim7Q923T7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim7Q923T7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim7Q923T7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim7Q923T7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim7Q923T7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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