Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf3Q922U1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms