Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clip1Q922J3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms