Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6cQ91ZQ1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms