Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rrp1bQ91YK2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1bQ91YK2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms