Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rprd1aQ8VDS4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms