Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms