Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slf1Q8R3P9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slf1Q8R3P9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slf1Q8R3P9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms