Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms