Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trpv3Q8K424 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpv3Q8K424 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpv3Q8K424 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpv3Q8K424 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpv3Q8K424 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpv3Q8K424 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpv3Q8K424 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpv3Q8K424 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpv3Q8K424 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpv3Q8K424 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpv3Q8K424 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpv3Q8K424 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpv3Q8K424 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpv3Q8K424 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpv3Q8K424 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpv3Q8K424 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpv3Q8K424 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpv3Q8K424 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpv3Q8K424 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpv3Q8K424 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpv3Q8K424 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trpv3Q8K424 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms