Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms