Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgbQ8K0E8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgbQ8K0E8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgbQ8K0E8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgbQ8K0E8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgbQ8K0E8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgbQ8K0E8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgbQ8K0E8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgbQ8K0E8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgbQ8K0E8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgbQ8K0E8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgbQ8K0E8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FgbQ8K0E8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FgbQ8K0E8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms