Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d5Q8JZW5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms