Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms