Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A430089I19RikQ8C9W1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A430089I19RikQ8C9W1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A430089I19RikQ8C9W1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A430089I19RikQ8C9W1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A430089I19RikQ8C9W1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A430089I19RikQ8C9W1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A430089I19RikQ8C9W1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A430089I19RikQ8C9W1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A430089I19RikQ8C9W1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A430089I19RikQ8C9W1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A430089I19RikQ8C9W1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A430089I19RikQ8C9W1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A430089I19RikQ8C9W1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A430089I19RikQ8C9W1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A430089I19RikQ8C9W1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A430089I19RikQ8C9W1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A430089I19RikQ8C9W1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
A430089I19RikQ8C9W1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A430089I19RikQ8C9W1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A430089I19RikQ8C9W1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A430089I19RikQ8C9W1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.5 ms