Protein–RNA interactions for Protein: Q8C407

Yipf4, Protein YIPF4, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf4Q8C407 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Yipf4Q8C407 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Yipf4Q8C407 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Yipf4Q8C407 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Yipf4Q8C407 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms