Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdac7Q8C2B3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms