Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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