Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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