Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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