Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTH8

Csnk1g1, Casein kinase I isoform gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1g1Q8BTH8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Csnk1g1Q8BTH8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Csnk1g1Q8BTH8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Csnk1g1Q8BTH8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Csnk1g1Q8BTH8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Csnk1g1Q8BTH8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1g1Q8BTH8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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