Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Atg4dQ8BGV9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Atg4dQ8BGV9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Atg4dQ8BGV9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Atg4dQ8BGV9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Atg4dQ8BGV9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Atg4dQ8BGV9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Atg4dQ8BGV9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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