Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpped1Q8BFS6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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