Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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