Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms