Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms