Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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