Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rasa4Q6PFQ7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rasa4Q6PFQ7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rasa4Q6PFQ7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rasa4Q6PFQ7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rasa4Q6PFQ7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rasa4Q6PFQ7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rasa4Q6PFQ7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rasa4Q6PFQ7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rasa4Q6PFQ7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rasa4Q6PFQ7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rasa4Q6PFQ7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rasa4Q6PFQ7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rasa4Q6PFQ7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rasa4Q6PFQ7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rasa4Q6PFQ7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasa4Q6PFQ7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasa4Q6PFQ7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasa4Q6PFQ7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasa4Q6PFQ7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasa4Q6PFQ7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rasa4Q6PFQ7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms