Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Casc4Q6P2L7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms