Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms