Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.59
NipblQ6KCD5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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