Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVL5

Lcn12, Epididymal-specific lipocalin-12, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn12Q6JVL5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lcn12Q6JVL5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Lcn12Q6JVL5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Lcn12Q6JVL5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Lcn12Q6JVL5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn12Q6JVL5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms