Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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