Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt42Q6IFX2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms