Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
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Pdzrn3Q69ZS0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Pdzrn3Q69ZS0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Pdzrn3Q69ZS0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Pdzrn3Q69ZS0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Pdzrn3Q69ZS0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Pdzrn3Q69ZS0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Pdzrn3Q69ZS0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzrn3Q69ZS0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Pdzrn3Q69ZS0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Pdzrn3Q69ZS0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Pdzrn3Q69ZS0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Pdzrn3Q69ZS0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Pdzrn3Q69ZS0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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