Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms