Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg9aQ68FE2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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