Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef39Q66JY6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arhgef39Q66JY6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms