Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Znf260Q62513 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf260Q62513 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms