Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CochQ62507 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CochQ62507 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CochQ62507 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CochQ62507 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CochQ62507 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CochQ62507 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CochQ62507 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CochQ62507 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CochQ62507 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CochQ62507 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms