Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema5aQ62217 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema5aQ62217 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms