Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms