Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms