Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin1Q61644 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin1Q61644 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin1Q61644 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin1Q61644 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacsin1Q61644 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacsin1Q61644 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacsin1Q61644 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacsin1Q61644 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacsin1Q61644 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacsin1Q61644 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin1Q61644 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms