Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms